配置方面：域名和服務器。
網站開發需要一個域名和服務器，并且域名是網站的重要入口，所以，有的公司會花大價錢去購買域名，或者好的服務器。小程序呈現上看，似乎不需要域名。其實，小程序也是需要域名的，不過，域名不重要和不呈現，同樣，小程序也需要購買服務器。
類型方面：展示型、交易型
從功能上看，網站可以大致分為展示型、營銷型、交易商城（交易型）幾種。而小程序，根據功能劃分，也可以分為展示型、交易型（小程序商城）。
制作方面：外包、自建、模板
如果客戶想要制作網站，在工作方式方面，有幾種不同的選擇，可以選擇自己組建團隊，自己設計和運營；也可以選擇外包給建站公司；還可以選擇模板建站系統，購買系統自助建站。上線小程序也是一樣，可以外包給設計公司，也可以自己組建團隊，還可以購買有贊這樣的模板開發商。
功能方面：承載內容和功能多少不同
目前的建站技術，可以讓網站呈現大量的內容和功能。即便如社交平臺這樣復雜的功能、如游戲這樣大的容量，網站也是可以承載的，并且借助分布式的構架，可以讓用戶獲得良好的使用體驗。但是，小程序則不然。一個小程序承載內容是有限的，承載的功能也較為單一，應該避免單個小程序承載過重的功能。
審核權方面：自主權利大小有別
做網站，受到的限制是比較少的，網站的內容、服務審核權，都在網站所有者手中。甚至，一些灰色的行業和公司，只要通過域名備案，也能夠借助網站宣傳業務。但是，小程序審核就比較嚴格，代碼需要提交平臺審核，內容和產品也會被平臺巡查，所有者的權限是收到約束的。
價格方面：不同類型差異較大
總體上看，同類型的網站和小程序，小程序的開發費用要低于網站。一方面是小程序的功能較為單一、布局較為規整、增值功能無法接入，所以，價格便宜。而網站可能需要優化代碼、增加更多功能、需要后臺程序、需要建立數據庫，導致開發成本高企。
